Sandy Cheeks merupakan ahli biologi kelautan yang tinggal di Bikini Bottom untuk mengumpulkan data. Selain meneliti biota laut, termasuk bulu babi, Sandy juga sangat pintar dan bisa menciptakan berbagai macam gadget. Pada suatu hari, Bikini Bottom menghadapi masalah besar. Kawasan tersebut tiba-tiba dikeruk manusia. Seluruh kehidupan Bikini Bottom dibawa B.O.O.T.S Marine Biology Lab yang berada di Galveston, Texas. Semua dibawa, mulai dari rumah nanas SpongeBob, Patrick Star, Mr. Crab. Squidward, seluruh warga dan kehidupannya. Bikini Bottom pun jadi bak tanah kosong tanpa warganya. Saat pengerukan hendak dimulai, Sandy segera menarik SpongeBob untuk menjauh. Hal tersebut membuat mereka berdua dan Sparky, kuda mesin ciptaan Sandy, menjadi yang tersisa di dalam laut. Namun, situasi itu membuat Sandy tak tinggal diam, terlebih lagi B.O.O.T.S merupakan laboratorium tempatnya bekerja, sebelum ditempatkan di Bikini Bottom. Sandy mencoba cari tahu informasi lebih lanjut dengan menghubungi rekan kerjanya di B.O.O.T.S. Ali-alih mendapatkan kejelasan, ia malah mengetahui situasi terbaru mengenai kerja sama pembangunan water parks yang dimiliki Sue Nahmee.